CGIはどのように設置・設定したらいいでしょうか？また、CGIのパスはどうなりますでしょうか？

CGIは通常であれば、設置されたドメインのrootにftpで接続していただきますと、/cgi-bin/というフォルダがあります。こちらにアップ、設置・設定していただきますと、http://お客様ドメイン名/cgi-bin/cgiの初期アドレスという形でアクセスができるようになります。

CGIのパスは
#!/usr/bin/perl
になります。

パーミッション（属性）の設定を間違えないように設定してください（通常は755）。